Конституция - не уголовный кодекс. Но на основании её создаются и кодексы и все прочие законы. И все они должны ей соответствовать. В конституции и о том что нельзя убивать не написано.
Статья 2
Человек, его права и свободы являются высшей ценностью. Признание, соблюдение и защита прав и свобод человека и гражданина - обязанность государства.
А что это если не защита жизни и свободы граждан?
Несомненно! Но ведь прямого указания на запрет убийства тут нет. Так же как в 14-й статье есть информация о том, что Россия светское государство, но прямого запрета на проведение религиозных мероприятий в государственных учреждениях нет.

Церковь не вмешивается в дела государства, кстати, новый курс предложила не церковь и в школьные программы не она это вводит.
Правильно. Это государство делает реверанс в сторону церкви, нарушая собственную же конституцию. Претензии не к церкви, а к государству.